[发明专利]前列腺癌发病风险基因评估方法及诊断试剂盒

权利要求书

1.一种通过检测基因多态性变异位点早期评估前列腺癌风险的方法及诊断试剂盒，适用于对体检人群、具有癌症家族史及有检查意愿的个体进行前列腺癌发病风险评估和早期诊断。其特征在于，检测基因为人类骨桥蛋白(Osteopontin，OPN)基因。人类OPN基因定位在4q21-q25，也称SECRETED PHOSPHOPROTEIN 1或SPP1，MIM ID为166490。

2.如权利要求1中所述的通过检测人类OPN基因多态性变异位点早期评估前列腺癌风险的方法及诊断试剂盒，其特征在于，包括OPN基因的以下9个多态性变异位点：(注：多态性变异位点定位参照人类OPN基因序列，GenBank D14813，序列见“核苷酸或氨基酸序列表”)

1)SNP(10)，定位在OPN基因启动子领域第2122位置，多态性变异类型为T/G。

2)SNP(11)，定位在OPN基因启动子领域第2123位置，多态性变异类型为G/T。

3)SNP(13)，定位在OPN基因5’UTR领域第2317位置，多态性变异类型为C/T。

4)SNP(15)，定位在OPN基因5’UTR领域第2337位置，多态性变异类型为C/T。

5)SNP(22)，定位在OPN基因内含子1领域第2337位置，编号rs2853749，多态性变异类型为C/T。

6)SNP(23)，定位在OPN基因内含子1领域第2337位置，编号rs2853750，多态性变异类型为A/G。

7)SNP(35)，定位在OPN基因内含子3领域第位置，编号rs6532039，多态性变异类型为A/G。

8)SNP(49)，定位在OPN基因外显子6领域第位置，编号rs4754，多态性变异类型为C/T。

9)SNP(59)，定位在OPN基因外显子7领域第位置，编号rs1126616，多态性变异类型为T/C。

其中A代表腺嘌呤，G代表鸟嘌呤，C代表胞嘧啶，T代表胸腺嘧啶。

3.如权利要求1和2中所述的9个SNP位点可单独或两个及两个以上位点组成等位基因单体型，也可与OPN基因中或基因外附近的其他SNP位点组成单体型用于评估前列腺癌发病风险和作为前列腺癌诊断试剂盒的靶点，也可用于鉴别诊断前列腺癌与前列腺增生。

4.如权利要求1至4中所述的SNP(10)和SNP(11)，其特征在于，与定位在OPN基因2113位置的SNPrs3841116(-/G/T)相关，当SNPrs3841116为“-”碱基缺失时，SNP(10)为“T”，SNP(11)为“G”；当SNPrs3841116为“G/T”时，SNP(10)和(11)的等位基因均为“G/T”。

5.如权利要求1至4中所述的通过检测人类OPN基因多态性变异位点早期评估前列腺癌风险的方法及诊断试剂盒，其特征在于，包含有SNP(10)、SNP(11)、SNP(13)、SNP(15)、SNP(22)、SNP(23)构成的单体型组合与前列腺癌发病风险相关。其中，SNP10-11-13-15-22-23构成的单体型为T-G-C-C-T-G的个体明显增加前列腺癌发病风险(P＝3.64×10^-6)，而为G-T-C-C-T-G的个体显著降低前列腺癌发病风险(P＝0.0185)。

6.如权利要求1至4中所述的通过检测人类OPN基因多态性变异位点早期评估前列腺癌风险的方法及诊断试剂盒，其特征在于，包含有SNP(35)、SNP(49)、SNP(59)构成的单体型组合与前列腺癌发病风险相关。其中，SNP35-49-59构成的单体型为G-T-C的个体的前列腺癌发病风险将显著降低6.4倍(P＝0.0069)。

7.如权利要求1至4中所述的通过检测人类OPN基因多态性变异位点早期评估前列腺癌风险的方法及诊断试剂盒，其特征在于，包含有SNP(35)、SNP(49)、SNP(59)构成的单体型组合也可用于鉴别诊断前列腺癌与前列腺增生，当单体型为A-C-T时，前列腺癌的可能性明显增加(P＝0.002)，而单体型为G-T-C时前列腺增生的可能性增加(P＝0.002)。