[发明专利]检测靶DNA序列的方法和采用该方法的基因芯片及应用

权利要求书

1.检测靶DNA序列的方法，其特征在于：其包括如下步骤，

步骤1：将RNA探针与靶DNA接触并退火，所述的RNA探针的一端固定在基片上，RNA探针包括靠近固定端的检测序列和靠近游离端的记号序列，所述的靶DNA具有与RNA探针中检测序列互补的区段；

步骤2：用核糖核酸酶水解退火后形成的DNA:RNA异源双链中RNA部分，释放出靶DNA和该RNA探针中的记号序列；

步骤3：洗涤除去游离的靶DNA、记号序列和核糖核酸酶，用记号DNA结合检测序列未被水解的固定在基片上的RNA探针，所述的记号DNA与RNA探针的记号序列互补，从而对靶DNA进行序列分析。

2.根据权利要求1所述的检测靶DNA序列的方法，其特征在于：步骤2中的核糖核酸酶为核糖核酸酶H。

3.根据权利要求1所述的检测靶DNA序列的方法，其特征在于：步骤2中的记号DNA上带有标记。

4.根据权利要求3所述的检测靶DNA序列的方法，其特征在于：步骤2中的记号DNA上的标记为生物素标记、荧光标记或同位素标记。

5.根据权利要求1所述的检测靶DNA序列的方法，其特征在于：所述的靶DNA为单链DNA或双链DNA，所述的双链DNA在步骤1退火前变性形成单链DNA。

6.根据权利要求1至5中任意一种所述的检测靶DNA序列的方法，其特征在于：所述的步骤2中释放出的靶DNA与该体系中其他RNA探针上互补的检测序列再次退火结合，形成DNA:RNA异源双链，循环往复步骤2的过程直至体系中所有的含互补检测序列的RNA探针均被水解。

7.一种基因芯片，其特征在于，所述的RNA探针的一端固定在芯片载体上，RNA探针包括靠近芯片载体固定端的检测序列和靠近游离端的记号序列。

8.根据权利要求7所述的基因芯片，其特征在于：所述的芯片载体上设置阵列式样点，RNA探针根据检测序列的不同固定于不同的样点内。

9.根据权利要求8所述的基因芯片，其特征在于：向各个样点内加入样品DNA，按权利要求1至6中任意一种所述的方法进行操作后，检测各个样点内标记，样品DNA含有与芯片上未检测到标记的样点内RNA探针的检测序列互补的序列。

10.权利要求1至6中任意一项所述的检测靶DNA序列的方法的应用，其特征在于：该方法用于检测遗传背景相关基因或者用于检测细菌或病毒的基因或者用于检测转基因动植物的转基因成分。