[发明专利]一种红细胞吸附法联合RT-PCR检测具有血凝性病毒的方法无效
| 申请号: | 201010154786.4 | 申请日: | 2010-04-23 |
| 公开(公告)号: | CN102234692A | 公开(公告)日: | 2011-11-09 |
| 发明(设计)人: | 易建中;刘成倩 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 | 代理人: | 费开逵 |
| 地址: | 201106*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 红细胞 吸附 联合 rt pcr 检测 具有 血凝 性病 方法 | ||
技术领域
本发明涉及一种红细胞吸附法联合RT-PCR检测具有血凝性病毒的方法,具体涉及一种以新城疫为研究对象,采用红细胞吸附法联合RT-PCT检测具有血凝性病毒的方法。
背景技术
有些病毒能吸附于鸡、火鸡和鸭等动物的红细胞表面,并引起红细胞凝集,这种特性与病毒囊膜上的纤突所含血凝素和神经氨酸酶有关。具有这种特性的病毒主要有新城疫和禽流感等。
新城疫(Newcastle Disease,ND)是由新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)引起的一种极易传染的毁灭性疾病,典型症状是呼吸道、消化道黏膜出血,最常侵袭家鸡,也能感染许多其它家禽和野鸟,人也有易感性。该病1926年首次发现于印尼,同年发现于英国新城,因此得名新城疫。该病分布于世界各地,1928年我国已有该病的记载,1935年在我国有些地区流行。新城疫感染的死亡率高达100%,同高致病性禽流感同属A类病,给世界养禽业带来巨大的威胁。目前用于检测NDV的方法有血凝和血凝抑制试验、酶联免疫吸附试验、病毒分离法等,这些方法虽然可以对病原作出诊断,但却存在费时、代价高、敏感性和稳定性不够好的缺点。
发明内容
本发明所要解决的技术问题在于提供一种红细胞吸附法联合RT-PCR检测具有血凝性病毒的方法。以新城疫病毒(NDV)作为研究对象,选取NDV的核衣壳蛋白的核苷酸序列设计一对引物,利用其能吸附于鸡、火鸡和鸭等动物的红细胞表面这一重要生物学特性,建立一种适合于NDV快速检测的红细胞吸附联合RT-PCR法。本发明方法敏感性和稳定性都很好,具有较大的临床运用价值,也同样适合于禽流感等具有血凝性病毒的检测。
本发明的红细胞吸附法联合RT-PCR检测具有血凝性病毒的方法,具体包括以下步骤:
1)制备红细胞
用灭菌注射器吸取柠檬酸抗凝剂1mL(其用量为所需血量的1/4体积),从鸡翅静脉抽血4mL,置灭菌离心管内,加灭菌PBS10mL,以2000r/min离心5min,弃上清液,再加灭菌PBS 10mL悬浮血球,再以2000r/min离心5min,如此将红细胞洗涤三次即可。
2)红细胞吸附NDV
取出从鸡场采集的污染粪便0.1g,加2mLPBS振荡混匀,使病毒溶解于PBS中,以10000r/min离心5min,取离心后上清液加约50uL的红细胞,室温作用1小时,2000r/min离心5min,弃上清,沉淀即为含有NDV的红细胞。如果污染的病料中含极少NDV,可通过红血球多次吸附以集中NDV。
3)病毒RNA提取
RNA提取按Trizol-A+提取总RNA说明书进行。
4)RT-PCR扩增
i)引物设计与合成
根据GenBank上已公布的NDV-NP基因序列,设计合成了一对特异性引物,能扩增578bp的基因片段。引物序列如下:
NP-F1:5′TATTCTGTCTTCGGATTGCT 3′
NP-R1:5′GCTCCCACCTGCTGTATT 3′
以上引物均由上海捷瑞生物工程有限公司合成。
ii)反转录
冰上操作,在PCR管中依次加入焦碳酸二乙酯(DEPC)处理水6μL,5×反转录酶Buffer 4μL,dNTP Mixture(10mM)1μL,NP上游引物F11μL(10μM),RNA酶抑制剂1μL,NDV病毒RNA 5μL,AMV反转录酶2μL(5U/μL),总体积20μL。在冰上混合后,室温放置10min,42℃1h后冰上冷却2~3min;所得的反应液可立刻用于PCR反应或-20℃保存备用。
iii)PCR反应
在PCR管中依次加入反转录产物2μL,10×Buffer(Mg2+free)2.5μL,MgSO42μL,dNTP(10mM)1μL,NP-F1、NP-R1(10μM)各1μL,Taq DNA聚合酶(5U/μL)0.25μL,ddH2O 15.25μL;总体积25μL在冰上混合。
PCR反应条件:94℃预变性5min,94℃变性30s,49℃退火25s,72℃延伸60s,循环32次,最后72℃延伸10min。
5)敏感性试验
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