[发明专利]减少细菌中接合型质粒

权利要求书

1.减少编码连接到噬菌体受体的抗生素或毒力标记的质粒流行的方法，所述质粒携带于异质细菌培养物中的细胞内，所述方法包括：

a)使所述细菌培养物与足够的能够与所述受体结合的噬菌体受体特异性杀死剂接触，

其中所述接触允许所述受体特异性杀死剂与所述噬菌体受体结合并杀死含有所述接合型质粒的宿主细菌，从而减少异质细菌培养物内编码所述抗生素或毒力因子的接合型质粒的流行。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述流行的减少是：

a)所述细菌培养物中所述接合型质粒的绝对数量的减少；或

b)每个所述细菌培养物的成员的所述接合型质粒数量的减少。

3.如权利要求1所述的方法，其中所述流行的减少为至少2倍。

4.如权利要求1所述的方法，其中所述细菌培养物是：

a)处于对数生长阶段；

b)处于稳定状态生长阶段；

c)乳酸杆菌或乳制品加工培养物；

d)在水处理设施中；

e)在真核细胞或器官培养物中；

f)在真核宿主中；

g)在脊椎生物体中或脊椎生物体上；或

h)在哺乳动物中或哺乳动物上。

5.如权利要求1所述的方法，其中所述噬菌体受体特异性杀死剂是：

a)复层病毒(tectivirus)；

b)宽宿主范围的含有脂质的噬菌体；

c)PRD1噬菌体群的成员；

d)质粒依赖性宽宿主范围噬菌体；

e)复层噬菌体科(tectiviridae)；

f)以二十面体形态、脂质包含物、55-65nm直径头部和12-130nm尾部中的至少一个或多个为特征的噬菌体；

g)选自命名为PRD1、PRR1、PR3、PR4、PR5、L17、PR772、GIL01、pGIL01、BAM35或GIL16的噬菌体。

6.如权利要求1所述的方法，还包括以下步骤：将所述细菌培养物暴露于提供至少一个编码所述受体的所述接合型质粒从所述细菌培养物的供体成员到接受体成员的转移的交配对形成系统(mating pairformation system)，并且允许所述系统实现所述接合型质粒从所述细菌培养物的所述供体成员到所述接受体成员的转移，从而产生包含所述接合型质粒并表达所述噬菌体受体的宿主细菌。

7.如权利要求6所述的方法，其中所述接合型质粒：

a)选自不相容性群N、P或W质粒；

b)编码在所述噬菌体复制中重要的一个或多个其他基因；

c)编码一个或多个抗生素抗性或毒力标记；

d)是以与所述成员的染色体分离的DNA的形式；或

e)编码一个或多个菌毛基因。

8.如权利要求6所述的方法，其中所述交配对形成系统包含：

a)至少一个菌毛接合基因；

b)另一可移动元件转移系统。

9.如权利要求6所述的方法，其中所述：

a)允许是在至少30℃的温度下；

b)允许是在其中多个菌毛基因被表达的温度下；

c)实现是至少2小时的时间段；

d)供体是F+细菌细胞；

e)接受体是F-细菌细胞；

f)允许导致包含所述接合型质粒的所述细菌培养物的成员的增加；

g)供体是非致病性细菌菌株；或

h)供体和接受体的比例在1∶1的两个对数单位内。

10.如权利要求6所述的方法，其中所述接触是与：

a)对于每个包含所述编码所述受体的接合型质粒的细菌细胞至少10个噬菌体；

b)能够减少所述接合型质粒数量的噬菌体；

c)不能在包含所述质粒的所述成员中复制的噬菌体；或

d)不能在包含所述接合型质粒的所述培养物的成员中复制其核酸的噬菌体。