[发明专利]利用甲基化进行DNA计算的系统和方法

权利要求书

1、一种使用甲基化逻辑的方法，其包括：

产生具有多个赋值变量的逻辑语句，其中所述多个变量包括甲基化变 量和对应于未甲基化变量的所述甲基化变量的否定，

使混合物或样品甲基化，

逆转样品的甲基化状态；

通过一种或多种分离技术使所述混合物或样品分离以分离至少一种分 离的混合物；

解码所述至少一种分离的混合物；以及

读取所述至少一种分离的混合物以使所述逻辑语句与所述解码关联。

2、根据权利要求1所述的方法，其中所述方法对于验证生物学标记和/ 或产生或鉴定新的生物学标记是有效的。

3、根据权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种分离技术包括一 系列测定法。

4、根据权利要求1所述的方法，其中所述读取对于验证已有的生物学 标记或者产生和/或鉴定新的生物学标记是有效的。

5、根据权利要求1所述的方法，其中所述多个变量为特定基因。

6、根据权利要求1所述的方法，其中所述多个变量为一组基因。

7、根据权利要求1所述的方法，其中所述多个变量为基因上的一组位 点。

8、根据权利要求1所述的方法，其中所述多个变量具有至少一个用于 C-执行甲基化编码的胞嘧啶。

9、根据权利要求1所述的方法，其中所述多个变量具有至少一个用于 A-执行甲基化编码的腺嘌呤。

10、根据权利要求1所述的方法，其中所述多个变量是由单链DNA编 码的。

11、根据权利要求1所述的方法，其中所述多个变量是由双链DNA编 码的。

12、根据权利要求1所述的方法，其中所述多个变量是由甲基结合蛋 白编码的。

13、根据权利要求1所述的方法，其进一步包括产生逻辑电路。

14、用于解决一组遗传子句的系统，所述系统包括：

赋值变量，其中各变量对应于甲基化变量和所述变量的否定，所述否 定对应于未甲基化变量；

使用所述甲基化和未甲基化变量在给定的逻辑子句内解决AND、OR 和NOT布尔逻辑项，通过以下方式进行：

甲基化所述变量的给定混合物，

逆转样品的甲基化状态；

分离所述混合物以产生满足所述给定逻辑子句的需要的混合物。

15、根据权利要求12所述的方法，其中所述变量为特定基因。

16、根据权利要求12所述的方法，其中所述变量为一组基因。

17、根据权利要求12所述的方法，其中所述变量为基因上的一组位点。

18、根据权利要求12所述的方法，其中所述变量中的至少一个具有至 少一个用于C-执行甲基化编码的胞嘧啶。

19、根据权利要求12所述的方法，其中所述变量中的至少一个具有至 少一个用于A-执行甲基化编码的腺嘌呤。

20、根据权利要求12所述的方法，其中所述变量是由单链DNA编码 的。

21、根据权利要求12所述的方法，其中所述变量是由双链DNA编码 的。