[发明专利]快速定量检测活的双歧杆菌的方法无效
| 申请号: | 200710072321.2 | 申请日: | 2007-06-06 |
| 公开(公告)号: | CN101319250A | 公开(公告)日: | 2008-12-10 |
| 发明(设计)人: | 孟祥晨;庞睿;王超 | 申请(专利权)人: | 东北农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/06 |
| 代理公司: | 哈尔滨东方专利事务所 | 代理人: | 陈晓光 |
| 地址: | 150030黑龙江省哈尔滨*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 快速 定量 检测 杆菌 方法 | ||
1.一种快速定量检测活的双歧杆菌的方法,其特征是:取样后,将样品 10倍稀释后,进行EMA处理,然后提取样品的DNA,进行分子信标-实时 PCR检测,根据标准曲线计算双歧杆菌的含量,所述的DNA提取过程是: EMA处理后的含双歧杆菌制品,加入18%的柠檬酸钠和1M NaOH, 10000rpm离心10min,收集菌体细胞,用无菌超纯水洗涤后,悬浮于无菌超 纯水中,取菌悬液,加入到浓度为2%的Tritox-100液中,100℃水浴处理10min 后,立即置于冰水中冷却,所得上清液直接用于分子信标-实时PCR扩增, 所述的含双歧杆菌制品的重量份数为1,所述的柠檬酸钠的重量份数为0.15, 所述的NaOH的重量份数为0.1,所述的无菌超纯水的重量份数为0.1,所述 的菌悬液的重量份数为0.01,所述的Tritox-100液的重量份数为0.1,所述的 EMA处理:EMA用量终浓度为1.5μg/mL,在650W卤素光源照射时间为 2min,所述的分子信标-实时PCR检测,其引物/探针浓度比为 0.8μM/0.4μM,荧光信号采集的退火温度为40℃,Mg2+浓度为2.5mM,循 环参数为:
所述的引物包括正向引物和反向引物,其中Bif-F为正向引物,长度为19bp, 序列为5′-TCTGGCTCAGGATGAACGC-3′,结合位点落在长双歧杆菌16S rDNA序列的20~38bp号位置;Bif-R为反向引物,长度为20bp,序列为 5′-CACCGTTACACCGGGAATTC-3′,结合位点落在长双歧杆菌16S rDNA 序列的655~674bp号位置,所述的分子信标探针5′端标记荧光基团FAM,6- 羟基荧光素,荧光发射峰值在518nm处,3′端标记淬灭基团DABCYL,4-4′- (恶烷氨基苯偶氮)苯甲酸,荧光发射峰值在491nm处,两者之间构成能量 传递结构,分子信标序列为:
5′-FAM-CCAGGCATCCGGCATTACCACCCGTCCTGG-3′-DABCYL。
2.根据权利要求1所述的快速定量检测活的双歧杆菌的方法,其特征是: 所述的取样:无菌操作将充分混匀的含双歧杆菌制品的样品放入含有PBS缓 冲液的灭菌锥形瓶内做成1∶10的均匀稀释液,室温静置水合30min。
3.根据权利要求1所述的快速定量检测活的双歧杆菌的方法,其特征是: 所述的分子信标-实时PCR检测的方法的标准曲线是:以不同菌数的阳性模 板对数为横坐标,以PCR反应过程中出现荧光信号的初始循环数Ct为纵坐 标绘制双歧杆菌的标准曲线,浓度范围在2×108~2×104CFU/ml之间时,标 准曲线线性良好,相关系数R值大于0.97,所建立分子信标-实时PCR检测 标准曲线,Y=-3.568X+42.322。
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